Küçük hücreli olmayan akciğer kanseriyle ilişkilendirilmiş tümör süpressör genlerin multiplex ligation-depent probe amplification (MLPA) yöntemi ile metilasyon paternlerinin incelenmesi

Abstract

Akci er kanseri, tüm dünyada mortalitesi en yüksek kanser türüdür ve kardiyovasküler hastalıklardan sonra ölüm nedenleri arasında 2. sırada yer almaktadır. Metilasyon bir epigenetik mekanizma olup DNA düzeyinde herhangi bir mutasyon olmamasına ra men ilgili genin eksprese olmasını engelleyen bir moleküler mekanizmadır. Çalı mada henüz çok yeni bir yöntem olan Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification (MLPA) tekni i ile akci er kanserleriyle daha önce ili kilendirilmi 24 ayrı tümör süpressör genin promoter bölgelerinin metilasyon paternlerinin SALSA MSMLPA ME001 tumorsuppressor probemix kiti kullanılarak incelenmesi amaçlanmı tır. Bu çalı maya stanbul Yedikule Gö üs Hastalıkları Hastanesinde, histopatolojik olarak incelenerek “küçük hücreli olmayan akci er kanseri” tanısı almı 100 olgu dahil edildi..Her hastaya ait doku örneklerinden kanser dokusu içeren 5 mikronluk kesitlerden elde edilen DNA örnekleri çalı ma grubu olarak, aynı hastaya ait kanser dokusu içermeyen kesitlerden elde edilen DNA örnekleri de kontrol grubu olarak çalı maya alındı. Çalı mada, akci er kanserli tümöral ve çevre akci er dokularında birbirlerine yakın oranlarda en sık CDKN2B, BRCA1, CDH13 ve HIC1 prob bölgelerinde metilasyon görüldü. Yine tümöral ve çevre dokularda PTEN, TIMP3, ATM, VHL, CD44, CDKN1B, RASSF1, IGSF4 ve ESR1 prob bölgelerinde de metilasyon saptandı. APC, CDKN2A, MLH1, RARB, CHFR ve GSTP1 prob bölgelerinde farklı oranlarda, tümöral dokularda metilasyon görülürken, çevre akci er dokularında bu prob bölgelerinde metilasyon saptanmadı. Sonuç olarak MS MLPA yönteminin akci er kanserlerinin metilasyon profillerinin taramasında kullanılabilecek, ucuz ve hızlı sonuç verebilen bir teknik oldu u görülmü tür. MS MLPA yönteminin di er metilasyon tarama yöntemleriyle kar ıla tırılarak bir an önce senstivite ve spesivitesinin belirlenmesi ve akci er kanserinin erken tanısında rutin kullanıma geçirilmesi gerekti ini dü ünmekteyiz.