Ülkelerin yeraltı zenginlikleri arasında maden yatakları yanında artık mikrobiyal
çeşitlilik unsurları da değerlendirilmektedir. Mikrobiyal çeşitliliğe katkı sağlayacak her yeni
veri, ekonomik bir değer olarak düşünülmektedir. Bu tez çalışmasının amacı mikrobiyal
komunitesi belilerlenen asidik çevreden elde edilecek izolatlar ile maden derenaj sahalarının
ıslahına biyoteknolojik yaklaşım ile çözüm olabilmektir.
Tez çalışmasında asid maden derenajından 3 mevsimde yedi örneklem alanından su
örneği alınmıştır. Alınan örneklerin pH ve sıcakık değerleri ölçülmüş, kimyasal içeriği
belirlenmesi amacıyla metal analizi yapılmışır. Kültüre bağlı ve kültürden bağımsız
yöntemler birlikte uygulanmıştır. Kültürden bağımsız yöntemler arasında DGGE, 16S rRNA
klon kütüphanesi, FISH ve metagenomik analiz yer almaktadır. Metagenomik ve diğer
yöntemlerde elde edilen mikrobiyal komunite verilerine göre seçici besiyerleri de
kullanılarak izolasyon çalışmaları devam ettirilmiştir. Elde edilen izolatlardan Fe+2
oksidasyon seviyelerinin takibi yapılmıştır.
Alınan su örneklerinin demir, altın, alüminyum, manganez, sülfür ve çinkoca zengin
olduğu tespit edilmiştir. Kültüre bağlı çalışmalar sonucunda Acidiphilium, Acidithiobacillus
ve Leptospirillum cinsi bakteriler izole edilmiştir. DGGE ve klon kütüphanesi sonuçlarına
göre baskın olarak Acidiphilium, Metallibacterium, Acidithiobacillus, Leptospirillum cinsi
bakteriler yer aldığı gösterimiştir. 16S Amplikon dizileme ile elde edilen ham verilerin
biyoinformatik analizi sonucunda baskın olan mikroorganizmaların Acidiphilium,
Metallibacterium, Aciditerrimonas, Acidithiobacillus, Leptospirillum; Ferroplasma,
cinslerine ait olduğu tespit edilmiştir. Fe+2 oksidasyon seviyelerinin belirlenmesi sonucunda,
üçüncü sezon alınan örnekten izole edilen Leptospirillum sp.’nin %81 oranında oksidasyon
yaptığı bulunmuştur. Bu tez çalışmas ıile heterotrof besiyerinde izole edilen yeni türe aday
mikoorganizma izole edilmiş. Türkiye’de ilk kez asid maden drenajının prokaryotik
çeşitliliği metagenom yaklaşımla belirlenmiş ve yüksek oranda Fe+2 oksidasyon yeteneğine
sahip Leptospirillum ferrooxidans ile biyomadencilik çalışmalarının devam edilebileceği
gösterilmiştir
Microbial diversity elements have been evaluated among the underground riches of
the countries like mineral deposits. New data related microbial diversity is thought as an
economical value. The aims of this thesis are to be a solution in biotechnological approach
of breeding of mine drainage sites and isolates from acidic environment.
In the thesis, acid mine drainage samples were taken in three seasons whose pH,
temperature were measured and metal analysis were performed to determine the chemical
content. Both culture-independent and culture-dependent analysis of the samples were
performed. Culture independent techniques, DGGE, 16S rRNA clone library, FISH and
metagenomics, were applied. According to the microbial community data obtained by
metagenomics and other methods, isolation studies were continued by using selective media.
Fe +2 oxidation screening study was carried out among the isolates.
Water samples were rich in iron, gold, aluminium, manganese, sulphur and zinc. As
a result of culture-related studies, Acidiphilium, Acidithiobacillus and Leptospirillum were
isolated. The dominant bacteria are found to be Acidiphilium, Metallibacterium,
Acidithiobacillus, Leptospirillum, according to the results of DGGE analysis and clone
libraries. Metagenomics approach has been exhibited Acidiphilium, Metallibacterium,
Aciditerrimonas, Acidithiobacillus, Leptospirillum, Ferroplasma. According to Fe+2
oxidation screening, Leptospirillum was selected with 81% oxidation in reaction. The
candidate microorganism grown on the heterotroph medium was isolated in this thesis.
Prokaryotic diversity of the acid mine drainage in Turkey have been determined for the firtst
time by metagenomics approach and an isolate with high oxidation of Fe+2 has been shown
to be ability for biomining studies
