Konjenital kalp hastalıkları (KKH) toplumda en sık görülen konjenital malformasyonlar
olup, süt çocukluklarında %1 sıklıkta izlenmektedir. Konjenital kalp hastalıkları
etiyolojisinde yer alan nedenlerin %20-25’lik kısmını genetik nedenler oluşturmaktadır.
İzole/non-sendromik konjenital kalp hastalıkları herhangi bir ilave doğumsal
malformasyonun veya nörolojik bulgunun eşlik etmediği gruptur. Bu grupta rol oynayan
moleküler yolakların genellikle primordial kardiyojenik odaklar, kardiyak kresent,
primitif kalp tüpleri, primitif atriyumlar, primitif ventriküller, girim ve çıkım yolaklarının
morfogenezi sırasında kesintiye uğraması sonucu hastalığın ortaya çıktığı
düşünülmektedir. Bu çalışmada, ekokardiyografi ile değerlendirme sonrası non sendromik KKH tanısı alan ve yapılan mikroarray analizinde herhangi bir patojenik/olası
patojenik kopya numarası değişikliği saptanmayan 0-18 yaş grubundaki 40 hasta ve
benzer yaş grubunda olan 40 kontrol bireyde, KKH etiyolojisinde yer aldığı bilinen
MYH6, NKX2-5, GATA4, NOTCH1, TBX1 genleri yeni nesil dizi analizi yöntemi ile
dizilendi. Saptanan tüm varyantlar ACMG kriterlerine göre sınıflandırılıp patojenite
skorlaması yapıldı. Patojenik/olası patojenik sınıfına uygun herhangi bir varyant
saptanmamış olmakla birlikte, NKX2-5 geninde (NM_004387.3) c.355G>T
p.(Ala119Ser) varyantı, NOTCH2 geninde (NM_017617.3) c.700C>T p.(Arg234Cys)
varyantı ve MYH6 geninde (NM_002471.3) c.3251+72G>A (rs372656808) varyantları
‘’Klinik Önemi Bilinmeyen Varyant’’ olarak sınıflandırıldı ve kontrol grubunda bu
varyantlara rastlanmadı. Saptanan varyantların segregasyon çalışmaları yapıldı ve çalışma
sonuçları literatür verileri ile kapsamlı bir şekilde değerlendirildi
Congenital heart disease is the most common congenital malformation in the
population. The prevalence of the disease is 1% in the infantile period. All the known
genetic factors explain approximately 20-25% of the cases. Nonsyndromic congenital
heart diseases are the heart defects without any detected extracardiac anomalies or
neurologic symptoms. Disruption of the molecular pathways during the morphogenesis
of the primordial cardiogenic cords, primitive cardiac tubes, primitive atrium, primitive
ventricles and ouflow tracts are believed to be the main reasons of the nonsyndromic
congenital heart disease. In this study, MYH6, NKX2-5, GATA4, NOTCH1 and
TBX1 genes, that are known to be involved in the etiology of nonsyndromic congenital
heart disease, were sequenced by next generation sequencing platform in the 40
patients between the ages of 0-18. Patients were diagnosed with congenital heart
defects by echocardiography and did not have any likely pathogenic/pathogenic CNVs
detected by microarray analysis. Also age-matched 40 controls without any cardiac
defects were evaluated. All the variants are analyzed and classified according to the
ACMG criteria. There were no pathogenic or likely pathogenic variants according to
the classification, yet c.355G>T p.(Ala119Ser) variant in NKX2-5 gene, c.700C>T
p.(Arg234Cys) variant in NOTCH1 gene and c.3251+72G>A (rs372656808) variant in
MYH6 gene were classified as ‘‘Variant of Uncertain Significance’’ and were not
detected in the control group. Segregation analyses have been done for the relevant
variants and the results are evaluated with previously published literature
